Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDV3Q9UKY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms