Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR3Q9UJK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR3Q9UJK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms