Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms