Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASIC3Q9UHC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms