Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MLH3Q9UHC1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MLH3Q9UHC1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms