Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARGC1AQ9UBK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGC1AQ9UBK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms