Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cry2Q9R194 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cry2Q9R194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms