Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NrkQ9R0G8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NrkQ9R0G8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NrkQ9R0G8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms