Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zeb2Q9R0G7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zeb2Q9R0G7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb2Q9R0G7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms