Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad1Q9QWZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad1Q9QWZ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad1Q9QWZ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rad1Q9QWZ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad1Q9QWZ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad1Q9QWZ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms