Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dkk3Q9QUN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dkk3Q9QUN9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms