Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acsl4Q9QUJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acsl4Q9QUJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms