Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH4Q9P2E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH4Q9P2E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms