Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDH10Q9P2E7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDH10Q9P2E7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms