Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms