Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TVP23BQ9NYZ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms