Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA8Q9NY65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms