Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf42Q9NWW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf42Q9NWW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2orf42Q9NWW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms