Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJC17Q9NVM6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms