Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MED17Q9NVC6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms