Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLBQ9NRJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms