Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPRD1BQ9NQG5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms