Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A20Q9NP91 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms