Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdc42ep4Q9JM96 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms