Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrfQ9JM73 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrfQ9JM73 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrfQ9JM73 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms