Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabgef1Q9JM13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rabgef1Q9JM13 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms