Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkpQ9JLV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PnkpQ9JLV6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms