Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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