Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmod4Q9JLH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod4Q9JLH8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod4Q9JLH8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms