Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Extl1Q9JKV7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Extl1Q9JKV7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Extl1Q9JKV7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Extl1Q9JKV7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Extl1Q9JKV7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Extl1Q9JKV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms