Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms