Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3m1Q9JKC8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap3m1Q9JKC8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap3m1Q9JKC8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap3m1Q9JKC8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms