Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx20Q9JJY4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx20Q9JJY4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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