Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube2Q9JJS0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube2Q9JJS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms