Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Exosc9Q9JHI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Exosc9Q9JHI7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Exosc9Q9JHI7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms