Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAB2Q9HCS7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms