Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK3Q9H422 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIPK3Q9H422 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIPK3Q9H422 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIPK3Q9H422 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms