Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDCBP2Q9H190 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDCBP2Q9H190 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCBP2Q9H190 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms