Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock2Q9ER58 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spock2Q9ER58 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spock2Q9ER58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms