Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a1Q9EPE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a1Q9EPE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 920.2 ms