Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Foxp4Q9DBY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Foxp4Q9DBY0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxp4Q9DBY0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxp4Q9DBY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms