Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp27a1Q9DBG1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms