Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AplfQ9D842 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms