Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms