Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl40Q9D783 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl40Q9D783 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms