Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc7Q9D541 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc7Q9D541 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms