Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc105Q9D4K7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc105Q9D4K7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms