Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Efhd1Q9D4J1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efhd1Q9D4J1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efhd1Q9D4J1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms