Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms