Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D930007J09RikQ9D2K6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D930007J09RikQ9D2K6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms